Giunsa pagbukas, pag-edit, ug pag-convert sa mga file sa PDB
Ang usa ka file nga may extension sa PDB file lagmit usa ka file nga gimugna sa Program Database format nga gigamit sa pagpugong sa pag-debug sa kasayuran mahitungod sa usa ka programa o module, sama sa DLL o EXE file. Usahay kini gitawag nga simbolo nga mga file.
Ang mga PDB nga mga file naghimo sa mapa sa nagkalain-laing mga sangkap ug mga pahayag sa usa ka source code ngadto sa katapusang gitigum nga produkto, nga mahimo gamiton sa debugger aron makit-an ang source file ug ang nahimutangan sa executable kung diin kini kinahanglan mohunong sa proseso sa pag-debug.
Ang pipila ka mga file sa PDB mahimong anaa sa Protein Data Bank file format. Kini nga mga file sa PDB mao ang yano nga mga file sa text nga nagtipig sa mga koordinado mahitungod sa mga istruktura sa protina
Ang ubang mga file sa PDB lagmit gibuhat sa Palm Database o PalmDOC file format ug gigamit sa PalmOS mobile operating system . Ang ubang mga file sa niini nga format magamit sa extension sa .PRC file.
Unsaon Pag-abli sa usa ka File sa PDB
Ang lainlaing mga programa naggamit sa ilang kaugalingon nga PDB file aron sa pagtipig sa mga datos sa usa ka matang sa structured database format, busa ang matag aplikasyon gigamit sa pagbukas sa kaugalingon nga tipo sa PDB file. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio, ug Pegasus mga pipila lang ka mga ehemplo sa mga programa nga mahimong mogamit sa PDB file isip usa ka database file. Ang Radare ug PDBparse mahimong magtrabaho usab sa pagbukas sa mga file sa PDB.
Ang ubang mga file sa PDB gitipigan isip yano nga teksto, sama sa Geneious 'Program Debug Database nga mga file, ug hingpit nga mabasa sa tawo kon mabuksan sa usa ka text editor. Mahimo nimo mabuksan kini nga matang sa PDB file sa bisan unsang programa nga makabasa sa mga dokumento nga teksto, sama sa built-in nga Notepad nga programa sa Windows. Ang uban pang mga PDB file viewers ug mga editors naglakip sa Notepad ++ ug Brackets.
Ang ubang mga PDB database files dili mga dokumento sa teksto ug mapuslanon lang kung ablihan sa programa nga gituyo alang niini. Pananglitan, kon ang imong PDB nga file may kalabutan sa usa ka paagi sa Quicken, nan sulayi gamit ang software aron makita o i-edit ang PDB file. Ang Visual Studio naglaum nga makakita sa usa ka PDB file sa sama nga folder sama sa DLL o EXE file.
Mahimo nimo makita ug ma-edit ang mga file sa PDB nga Protein Data Bank file, sa Windows, Linux, ug MacOS uban sa Avogadro. Ang Jmol, RasMol, QuickPDB, ug USCF Chimera mahimo usab magbukas sa usa ka PDB file. Tungod kay kini nga mga file mga yano nga teksto, mahimo usab nimo mabuksan ang PDB file sa usa ka editor sa text.
Ang Palm Desktop kinahanglan nga makahimo sa pag-abli sa mga file sa PDB nga anaa sa Palm Database file format apan kinahanglan nimo nga pag-usab ang pag-usab sa kini nga adunay .PRC file extension alang niana nga programa sa pag-ila niini. Sa pag-abli sa PalmDOC PDB file, sulayi ang STDU Viewer.
Unsaon Pag-usab sa usa ka File sa PDB
Ang mga file sa Program Database mahimo nga dili mausab ngadto sa lain-laing format sa file, labing menos dili sa regular nga file converter tool . Hinunoa, kung adunay bisan unsang himan nga makahimo sa pag-convert niining matang sa PDB file, kini mahimong sama nga programa nga maka-abli niini.
Pananglitan, kung gikinahanglan nimo ang pag-convert sa imong PDB database file gikan sa Quicken, sulayi ang paggamit niana nga programa aron sa pagbuhat niini. Kini nga matang sa pagkakabig, hinoon, tingali dili gamay nga gamit apan wala usab gisuportahan sa mga aplikasyon sa database (nga tingali dili kinahanglan nga kinabig kini nga matang sa PDB file sa bisan unsang laing format).
Ang Protein Data Bank nga mga file mahimong makombertir sa ubang mga format uban sa MeshLab. Sa paghimo niini, mahimo nimo nga unang pag-convert sa PDB file sa WRL sa PyMOL gikan sa File> Save Image As> VRML menu, ug unya i-import ang WRL file sa MeshLab ug gamita ang File> Export Mesh As menu aron sa katapusan pag-convert sa PDB file sa STL o laing format sa file.
Kon dili nimo kinahanglan ang modelo nga mahimong kolor, mahimo nimo nga i-eksport ang PDB file direkta sa STL uban sa USCF Chimera (ang download link anaa sa ibabaw). Kay kon dili, magamit nimo ang sama nga pamaagi sama sa ibabaw (uban sa MeshLab) aron ma-convert ang PDB ngadto sa WRL sa USCF Chimera ug dayon i-export ang WRL file sa STL sa MeshLab.
Sa pag-convert sa PDB ngadto sa PDF o EPUB , kon ikaw adunay PalmDOC file, posible ang daghang mga paagi apan ang labing sayon tingali mao ang paggamit sa online nga PDB converter sama ni Zamzar . Mahimo nimo i-upload ang imong PDB file sa website nga adunay opsyon sa pag-convert sa mga format ingon man usab sa AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT, ug uban pang mga format sa eBook file.
Ang pag-convert sa PDB file sa format sa FASTA mahimong buhaton sa Meiler Lab sa online nga PDB sa FASTA converter.
Posible usab ang pagkombertir sa PDB sa CIF (Crystallographic Information format) online gamit ang PDBx / mmCIF.
Advanced nga Pagbasa sa PDB Files
Makabasa ka og daghan pa mahitungod sa mga file sa Program Database gikan sa Microsoft, GitHub, ug Wintellect.
Adunay labaw pa aron makat-on mahitungod sa Protein Data Bank file usab; tan-awa ang Worldwide Data Protein Bank ug RCSB PDB.
Ang Imong File Wala Pa Gihapon?
Ang mga file sa PDB nga wala magbukas sa bisan unsang mga himan gikan sa ibabaw, tingali dili tinuod nga PDB file. Unsa tingali ang nahitabo mao nga sayop ka nga nabasa ang extension sa file; ang ubang mga format sa file naggamit sa suffix nga kaamgid sa "PDB" kon sila walay kalabutan ug wala magtrabaho sa ingon.
Pananglitan, ang usa ka file sa PDF usa ka file sa dokumento apan ang kadaghanan sa mga programa gikan sa ibabaw dili maghatag sa husto nga teksto ug / o mga hulagway kon mosulay ka sa pag-abli sa usa niini nga mga program sa software. Tinuod usab kini alang sa uban nga mga file nga adunay susama nga spelling file extension, sama sa mga file sa PD, PDE, PDC, ug PDO.
Ang PBD usa usab nga gipanag-iya sa programa sa EaseUS Todo Backup ug busa mapuslanon lamang kung ablihan sa software.
Kon wala ka'y PDB file, dayon tun-i ang extension sa file nga anaa sa imong file aron imong makit-an ang angay nga programa nga nagbukas o nag-usab niini.